增强新生儿健康基因组测序作为主要筛查工具

世界各地通常使用生化检测方法进行新生儿筛查 (NBS)。基因测序的最新进展可能会改变新生儿筛查的游戏规则，能够快速评估各种单基因疾病。然而，基因测序作为 NBS 替代方法的有效性此前尚未被研究过。

为了评估将基因组测序作为一级新生儿筛查测试的结果，国家统计局八个中心和华大基因组最近进行的一项研究发表在《JAMA Network Open》上。

这项开创性研究将基因组测序纳入 NBS，作为大规模人口规模的同步一级筛查策略，这些结果表明，大约每 500 名新生儿中就有一个受益于将基因组测序作为一级筛查的整合测试。

方法和结果：

研究人员旨在评估基因测序方法检测新生儿单基因疾病的能力。这项前瞻性队列研究纳入了2021年2月21日至12月31日期间从中国八个新生儿筛查中心招募的29,601名新生儿。对结果呈阳性的新生儿在2022年7月5日之前进行了随访。

该筛选包括针对 128 种情况的生化筛选测试和靶向基因组测序测试。生化和基因组测试均可检测出其中 43 种病症，而其他 85 种病症仅通过基因组进行筛选。

主要发现包括：

1. 通过基因测序，813 名婴儿筛查呈阳性(2.7%;95% CI，2.6%-2.9%)，其中 402 名婴儿得到诊断，阳性预测值为 50.4%(95% CI，50.0%) -53.9%)。

2. 基因组测序确定了 59 名未通过生化检测检测到的患者，其中包括 20 名患有生化和基因筛查疾病的患者和 39 名仅患有基因筛查疾病的患者，这相当于每 500 名新生儿中就有 1 名(95% CI，1/ 385-1/625)。

3. 共有445名新生儿经NBS遗传和生化筛查确诊为13种疾病，其中包括G6PD缺乏症(328名新生儿)、先天性甲状腺功能减退症和单纯性HTT(94名新生儿)以及氨基酸、有机酸或脂肪酸氧化疾病(23 名新生儿)。虽然其中 82 名患者未通过基因 NBS 检测到(并通过生化 NBS 检测到)，但值得注意的是，其中 20 名患者通过基因 NBS 检测到(而未通过生化 NBS 检测到)。

4. 共鉴定出 328 名 G6PD 缺乏症患者(282 名男性和 46 名女性)。全部经基因NBS检出，但10例男性患者生化NBS未检出;相反，它们在验证性测试中得到了证实。总体而言，荧光测定的敏感性为 96.95%(95% CI，94.48%-98.33%)，特异性为 99.71%(95% CI，99.64%-99.77%)，而遗传 NBS 的敏感性为 100%( G6PD 缺乏症的特异性为 95% CI，98.84%-100%)，特异性为 98.61%(95% CI，98.46%-98.75%)。

利用 NBS 的基因测序

本研究将遗传 NBS 的结果呈现为临床环境中的一级筛查测试，这对于临床医生、遗传学家和家庭提供更好的医疗保健和咨询非常重要。

例如，将遗传与生化 NBS 相结合的一个好处是减少误报的数量。本研究的数据表明，除了女性新生儿中 G6PD 的荧光检测外，遗传 NBS 的阳性预测值 (PPV) 显着高于生化 NBS。氨基酸、有机酸和脂肪酸氧化障碍的差异非常明显(遗传 NBS 为 70.83%，串联质谱为 5.29%;P < .001)，这与之前的研究一致。减少误报数量反过来会减轻父母的压力和焦虑，并减少随访次数。

研究小组承认，需要进一步的研究和合作来在全球人群和医疗保健系统中验证这些发现，这将导致新生儿筛查方案的细化和优化。

该项目遵循生物和医学研究相关规定，并已获得八家新生儿筛查中心和华大基因伦理委员会的批准。